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L-issue

한 번에 끝내는 PCR
magazine 내용입니다.
제목 한 번에 끝내는 PCR 조회수 1288

PCR은 결과는  반응 튜브 안이 아니라,

준비하는 손끝에서 이미 결정됩니다. 

 

PCR은 단순한 분자생물학 기법이 아니라

실험의 속도와 재현성을 결정하는 연구실의 기본 인프라입니다. 

 

늘어나는 샘플 수, 반복되는 실험, 그리고 줄여야 하는 인적 오차까지 -

오늘의 PCR은 더 이상 증폭이 되느냐가 아니라

얼마나 안정적으로, 얼마나 효율적으로 준비할 수 있는지가 더 중요한 기준이 되고 있습니다. 

 

기본을 설계하는 Polymerase에서

세팅을 줄이는 Mater Mix를 거쳐

실수를 줄이는 PreMix까지 

 

i-StarTaq 라인업  바로가기

 

[조건 최적화 단계]

i-StarTaqTM DNA Polymerase

Hot-start 기술이 적용된 고특이성·고정확도 PCR 효소

반응 조건을 직접 조절할 수 있어 까다로운 타겟 최적화에 유리

  

 제품 특징

  · 비특이 밴드 감소 (Hot-Star 기반)
  · ​GC-rich template에서도 안정적인 증폭 성능 확인

  · ​다양한  template 적용 가능 (plasmid, genomic DNA, cDNA 등)

 

 ◆ PCR TIP : Template 양 조절

     권장 template 사용 범위

     Plasmid DNA : 10pg - 100ng

     Genomic DNA : 0.1 - 1 µg (single copy gene 기준)

     과도한 template는 오히려 PCR을 저해할 수 있습니다.

  

 PCR TIP : Primer 농도 최적화

    비특이 밴드 발생 시 primer 농도를 단계적으로 낮추는 것이 우선적인 해결 방법입니다.

    권장 범위 : 0.1 - 0.5 µM 범위에서 최적화 권장 (5-20 pmol 사용) 

  

[세팅 단순화 단계]

2X PCR Master Mix Solution (i-StarTaq)

Hot-start 기반 비특이 증폭 최소화

최적 비율 Premix로 실험 오차 감소 

  

 제품 특징

  ·​ Hot-Star 기능 기반 primer dimer 감소
  ·​ 반복 실험 간 밴드 강도의 일관된 재현성 확인
  ·​ Loading dye포함 PCR 후 바로 전기영동 가능
  ·​ 루틴 PCR 및 다수 샘플 실험에 적합 
 

◆ PCR TIP : Hot-Start 활성화를 위한 초기 변성 단계

     Hot-start 기반 효소의 특성상, 최기 변성 단계가 충분하지 않을 경우 비특이 반응이 증가 할 수 있습니다.

  

 ◆ PCR TIP : cDNA 사용 시 주의

     RT 반응액은 PCR 저해 요인이 될 수 있어

     cDNA 사용량은 전체 반응 부피의 10% 이하가 권장됩니다.

  

실험 편의성 포인트

》여러 PCR reagent를 하나로 [ 효소,dNTP,buffer가 최적 비율로 포함된 2x premix ]

》세팅 단계 단순화 [ Template,Primer,Water만 추가하면 반응 준비 완료 ]

》즉시 전기영동 가능 [ Loading dye 포함으로 PCR 후 바로 로딩 가능 ] 

 

[재현성 강화 단계]

MaximeTM PCR PreMix (i-StarTaq)

Hot-start 기반 안정적 고특이성 증폭

동결 건조 1튜브 시스템으로 세팅 편차 최소화 

  

제품 특징

 ·​ Hot-Star 기능 기반의 안정적인 고특이성 증폭 시스템
 ·​ 1 tube, 1반응 동결 건조 premix → 세팅 단계 최소화
 ·​ 반응 간 편차를 줄이는 batch QC 기반 제조
 ·​ Loading dye 포함 →전기영동 단계 단순화
 ·​ 대량 샘플  처리 및 반복 실험 환경에 최적화
 

 PCR TIP : 동결건조 pellet 사용 시

    water 첨가 후 바로 PCR을 하기 보다는 1~2분 두었다가 pipetting하면 pellet이 완전히 용해되어

    안정적인 반응 준비에 도움이 됩니다.

  

실험 편의성 포인트

》1 튜브 = 1반응 완제품  [ 동결건조 PreMix로 분준 단계 최소화 ]

》세팅 시간 단축 + 인적 오차 감소 [ 시약 aliquot가 필요 없는 구조 ]

》즉시 전기영동 가능 [ Loading dye 포함으로 반응 후 바로 gel 로딩 가능 ]

 

PCR 준비의 기준을 바꾸다

PCR은 오랫동안 증폭이 잘 되는가기준이던 기술이었습니다.

하지만 실험 환경이 바뀌면서, 이제 연구자와 실험실이 마주하는 문제도 달려졌습니다.

  

반응 성공률 보다 더 중요해진 것은

얼마나 빠르게 준비할 수 있는지,

얼마나 반복해도 결과가 흔들리지 않는지,

그리고 얼마나 사람의 실수를 줄일 수 있는지 입니다.

  

i-StarTaq PCR 라인업은

실험자의 역할이 시약을 섞는 사람에서

데이터를 해석하는 사람 으로 바뀌는 흐름에 맞춰

PCR 준비 과정을 단계적으로 단순화해 왔습니다.

  

i-StarTaqPCR을 더 쉽게 만드는 방향으로 지금 진화하고 있습니다. 

 

 

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