왜 Real-time PCR에 ”UDG master mix”가 필요할까?

 

“샘플도, 장비도, 그대로인데 NTC에서 애매한 시그널이 올라온 적 있으신가요?”

“이 신호가 진짜 양성인지, 실험실 오염인지 헷갈린다면 이제는 시스템 차원에서 해답이 필요합니다.”

 

 

RealMODTM Probe R2 바로 가기

 

 

“UDG가 답이 될 수 있을까?“     

• 사전 UDG 처리로 위양성과 재시험을 줄이고, PCR Product간 오염 걱정을 덜 수 있습니다.

• 추출된 DNA나 새로 합성되는 cDNA에는 영향을 주지 않아 효율적인 결과 신뢰성이 보장합니다.

 

 

“현장에서 바로 쓰는 RealMODTM R2 실험 팁“

Tip 1.  qPCR(R2 2x qPCR mix)

    - Multiplex 설계 시  타겟 간 Ct 차이를 과도하게 벌리지 않도록 조절하고, Primer-dimer가 의심되면

      Primer농도와  Tm을 조정해 줍니다.

    - Normal 조건에서 조건을 먼저 최적화한 뒤, annealing/extension 시간을 점진적으로 단축해 Fast   

       Protocol로 전환해도 Ct 변화는 최소화하면서 약 50분 내외 러닝 타임 구현 할 수 있습니다.

Tip 2. qRT-PCR(R2 2x qRT-PCR mix)

    - RNA는 추출 직후 바로 사용하거나, 분주 후 -80℃ 보관·동결 해동 횟수 최소화 등 기본적인 RNA관리가

      qRT-PCR 재현성에 직결 됩니다.

   - one-step qRT-PCR로 다수 시료를 스크리닝에 활용하고,타겟에 따라 RT온도 (50~55℃), annealing           

      온도(55~60℃)를 조합해 최적화하면 다양한 바이러스/유전자 패널에 쉽게 최적화 할 수 있습니다.

Tip 3. 공통 팁

   - 2x Master mix 구조를 활용해 primer, probe, template, water 만 분주하여 설계, pipetting 횟수를

     줄여 오염·에러를 동시에 감소 시킬 수 있습니다.

  - primer 250~500nM, probe 100~300nM 범위에서 시작해서 최적화를 진행하면 대부분의 타겟에서   

     안정적인 Ct와 증폭곡선을 얻을 수 있습니다. 

 

“RealMODTM R2 Series“

 

 ​RealMODTM R2 Performance Data

-[25363] RealMODTM Probe R2 2 X qPCR mix (with UDG)

 Fig 1. Performance comparison between normal & fast protocols using RealMOD™ Probe R² 2x qPCR mix (with UDG).

-(A) Normal PCR condition (96 min) (B) Fast PCR condition (50 min)

 “Normal vs Fast 조건에서도 거의 동일한 Ct값과 증폭곡선을 유지합니다.”

 

Fig 2. Multiplex PCR of various DNA using RealMOD™ Probe R² 2x qPCR mix (with UDG).

 -(A: C.trachomatisDNA , B: N.gonorrhoeaeDNA, C: T.vaginalisDNA, D: M.genitaliumDNA, E : 4 plexMultiplex PCR)

“4-plex Multiplex에서도 안정적인 증폭곡선을 유지합니다.” 

 

-[25362] RealMODTM Probe R2 2 X qRT-PCR mix (with UDG)

 Fig 1. Amplification of various RNA using RealMOD™ Probe R² 2x qRT-PCR mix (with UDG).

-(A) TGE virus, B: PED virus, C: RdRP gene D: E gene, E: N gene of SARS-CoV-2 virus)

“다양한 RNA 바이러스 증폭 성능＂ 

Fig 2. Performance comparison test.

 “경쟁사 대비 저 농도에서 Ct값 구현과 우수한 dynamic range를 보여줍니다.” 

  

“시료 준비부터 결과 분석까지 효율적인 워크플로우를 경험하세요“

 1. 시료 추출 : Patho Gene-spin HS DNA/RNA, easy-spin RNA, FaSTARprep96

 2. 증폭 : RealMODTM Probe R2 시리즈

 3. Real-time PCR : CFX96, QuantiStudio5, FaSTARamp96 Real-time PCR System

 

 

“ 오늘도 수많은 데이터가 쌓입니다. 그 중 진짜 신호만 골라 내는 힘,

 RealMODTM Probe R2에서 시작하세요.!”